南通市地处江苏省东南部，南临长江、东濒黄海、西接泰州、北靠盐城，形似半岛。南通属于冲积平原区，地势平坦，河沟成网。全市土地总面积8001km²。老通扬运河接如泰运河到沿海出口以南为长江流域，面积5748.68 Km²；以北为淮河流域，面积2251.97K m²。南通市位于东经120°12′至121°55′,北纬31°41′至32°43′之间,南北跨距114.2km，东西跨距158.8km。南通属于亚热带海洋性季风气候区，四季分明，雨量较丰沛，全市多年平均降水量1060mm，降水量年际变幅较大，站点最大年降水量1811.9mm（1991年），站点最小年降水量243.6mm（1933年）。多年平均气温15.3℃。平均年蒸发量860mm。

南通市境内河流水系经过多次大规模的整治建设，已初步形成了一个能引、能蓄、能控制、能调度、能通航利用的河网水系。主要骨干河道（一级河）有焦港河、如海运河、九圩港河、如泰运河、通扬运河、新通扬运河、通吕运河、通启运河、新江海河、?薏柙撕印⒁Ｍ?酆印⒈绷韬拥龋?艹?29.88公里。二级河道105条，总长1760.58公里。另外，还有众多三、四级河道。大部分河道在规划布局上分布均匀，交织成网，相互沟通，成为调节各级河网的枢纽。